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I Biologi di Stanford Affermano di Aver Scoperto Ciò che Già Sapevamo

Meno dello 0,3% dei nostri lettori ci finanzia, ma se ognuno di voi che legge questo ci supportasse, oggi potremmo espanderci e dare seguito ad un lavoro che riteniamo importante.

Questo è ciò che pubblicheranno, vedremo cosa suoneranno questa volta.

Mentre raccolgono e analizzano enormi quantità di sequenze genetiche di piante, animali e microbi, i biologi continuano a “trovare sorprese”, dicono (impressionante faccia tosta). L’ultima è riportata questa settimana in un Preview di un documento scientifico: un nuovo tipo di entità simile a un “virus” che abita i batteri della bocca e dell’intestino umano. Questi “obelischi”, come li chiama il team dell’Università di Stanford, hanno genomi a RNA.

È pazzesco”, afferma Mark Peifer, biologo cellulare e dello sviluppo presso l’Università del North Carolina, “Più guardiamo, più vediamo cose pazzesche”.

Certamente caro. “Non si sa ancora se gli obelischi influenzino la salute umana”, afferma Matthew Sullivan, biologo dell’Ohio University, ma potrebbero alterare l’attività genetica dei loro ospiti batterici, che a loro volta potrebbero influenzare i geni umani. Hanno già la scusa.

L’RNA è conosciuto come l’alter ego del DNA: trasporta le ricette per la produzione di proteine codificate in un gene basato sul DNA a “cucine” molecolari esterne al nucleo della cellula che legano tra loro gli aminoacidi di una proteina. Ma più di 200 “virus” hanno “genomi” composti esclusivamente da RNA. All’inizio del XX secolo, i biologi si sono imbattuti nei viroidi, fondamentalmente un anello di RNA senza il rivestimento proteico. A quanto pare, i genomi dei viroidi non codificano alcuna proteina. I viroidi hanno suscitato grande interesse perché interagiscono con i genomi delle piante, talvolta in modo devastante: ad esempio, causano l’arresto e la deformazione di patate, crisantemi e altre colture.

A lungo si è pensato che i viroidi fossero limitati alle piante, ma di recente sono state trovate prove di genomi di RNA circolari simili a viroidi nei database di sequenze animali e batteriche. In una nuova ricerca di genomi di RNA non ancora scoperti, il biologo Andrew Fire e i suoi colleghi di Stanford hanno sviluppato un software per analizzare i cataloghi di geni attivi dei microbi che vivono nell’uomo alla ricerca di sequenze di RNA che si prevede formino cerchi – la struttura del materiale genetico sia dei “virus” che dei viroidi. “Sono davvero impressionato dall’approccio”, afferma il biologo computazionale Simon Roux del Joint Genome Institute di Lawrence Berkeley, che ha lavorato a un documento del 2023 in cui si accennava al fatto che i batteri potessero contenere viroidi o entità simili.

La ricerca di Stanford ha prodotto quasi 30.000 cerchi di RNA previsti, ognuno dei quali era composto da circa 1.000 basi e probabilmente rappresentava un obelisco diverso. Il team ha concluso che è improbabile che si tratti di “veri virus”, perché i “virus” di RNA tendono ad avere molte più basi. Tuttavia, alcune sequenze dell’obelisco codificano proteine coinvolte nella replicazione dell’RNA, rendendole più complesse dei viroidi standard.

Tuttavia, come i viroidi, gli obelischi non sembrano codificare proteine che formano un guscio. Roux afferma che sono necessari ulteriori studi per capire quanto gli obelischi siano diversi dai viroidi e da altre particelle simili ai viroidi. Tra i database microbici umani esaminati, le sequenze di obelisco sono state trovate nel 7% dei batteri dell’intestino umano e nella metà dei batteri della bocca umana. Inoltre, gli obelischi nei microbi di diverse parti del corpo hanno sequenze distinte, riferiscono Fire e colleghi nel loro preprint, pubblicato il 21 gennaio su bioRxiv.

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Gli obelischi contengono geni diversi da quelli ancora scoperti in altri organismi, “comprendendo classi di RNA che hanno colonizzato e sono passati inosservati nei microbiomi umani e globali”, scrive il team. “Credo che questo lavoro indichi chiaramente che stiamo ancora esplorando le frontiere di questo universo virale”, afferma Roux, che è anche alla ricerca di nuovi tipi di entità “simili ai virus” e ha contribuito a compilare un database di oltre 15 milioni.

Ciò che trovo sconcertante”, afferma, “è che continuino a soffermarsi sul concetto obsoleto di ‘virus’, mentre hanno scoperto esattamente ciò che spiego nel mio libro ‘Io, negazionista’, ovvero che tali entità non sono altro che parti di noi stessi, esosomi messaggeri. Ora pretendono di “scoprire” gli obelischi, ribattezzandoli come qualcosa di nuovo, invece di riconoscere l’immenso errore che stanno commettendo da quasi due secoli. Non esistono virus di questo tipo, né si chiamano obelischi quelli che, come sappiamo, esistevano già da tempo. Alla fine è un’altra vittoria, riconoscono che noi siamo questi “virus”, nient’altro che informazioni genetiche trasponibili. Ma come dico sempre, qualcosa esiste se gli si dà un nome, loro creano una nuova parola per ciò che era già noto.

Fernando López-Mirones

Fonte: Vk Social

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